Portal interactivo para explorar mutaciones del genoma SARS-CoV-2. Proyecto interdisciplinar entre ingeniería de software y bioinformática, en colaboración con la Universitat Rovira i Virgili.
- 01 / ENTRADADatos genómicos
- 02 / PROCESOExploración visual
- 03 / SALIDAContexto científico
Resumen
- Portal interactivo para explorar mutaciones a lo largo del genoma del SARS-CoV-2
- Desarrollado en colaboración con la Universitat Rovira i Virgili
- Contribución en la intersección de ingeniería de software y bioinformática
- Publicado como herramienta de referencia para investigadores
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- Consultar el contexto del conjunto de datos y buscar spike en la tabla de genes.
- Seleccionar spike, Spain y un porcentaje superior a 50 con los controles nativos; enviar una consulta acotada. El país filtra la presencia de la mutación, no un porcentaje específico de ese país.
- Revisar las cuatro filas devueltas y localizar D614G con la búsqueda de texto de la tabla.
- Explorar el detalle emergente de una mutación en el gráfico, ampliar una región arrastrando y restablecer la vista.
Una colaboración interdisciplinar
Universitat Rovira i Virgili
Colaboración interdisciplinar orientada a convertir datos genómicos en una experiencia de consulta útil para investigación.
Genómica visual y análisis exploratorio
Ingeniería de software + bioinformática
Tecnologías
Desarrollador de Software (Prácticas) · Universitat Rovira i Virgili · Octubre de 2021 - Mayo de 2022